تأسست الكلية البحرية في الجمهورية العربية السورية عام 1975 م في مدينة اللاذقية، وكانت عبارة عن مجموعة من الأبنية البسيطة (2-3) بناء.إضافة إلى مجموعة من الفلايك والزوارق التدريبية. وفي عام 1980 انتقلت إلى موقعها الحالي في مدينة جبلة.
تعتبر المهمة الرئيسية للكلية البحرية تنشئة وإعداد أجيال جديدة من الضباط البحريين ورفد القوى البحرية بهم بعد تزويدهم بالعلوم العسكرية والبحرية والمعارف الثقافية والعلمية كي يصبحوا مؤهلين عقائدياً مؤمنين بقضايا أمتهم قادرين على قيادة مرؤوسيهم بعد تخرجهم، لأداء الواجب الوطني المقدس في الذود عن بلادهم وأمتهم.
تتألف الكلية البحرية من عدد من الفروع والأقسام التي تؤمن إمكانية الاضطلاع بالمهام المنوطة بها. وتعقد في الكلية دورات متنوعة لإعداد الضباط، والطلاب الضباط، ودورات لتأهيل صف الضباط بمختلف الاختصاصات البحرية.